Desde su inicio que posee un Laboratorio Microbiológico interno, que permite acompañar de forma próxima los ingredientes, procesos y productos.

Con el HACCP implementado desde 2000, Peipen ha apostado temprano en un enfoque preventivo de la seguridad alimentaria.

La ligación a las principales marcas del ramo alimenticio presentes en Portugal obligó a que la calidad en la empresa alinease por los exigentes referenciales de sus principales clientes, estando acreditada para muchos como fornecedor europeo.

Recientemente, con la entrada en el mercado internacional y en las marcas de grande distribución, la empresa ha visto su sistema de gestión de seguridad alimentaria certificada por SGS, en octubre de 2012, según la norma FSSC 22000.

Desde la elección de abastecedores, al control de materias primas, pasando por el rigoroso acompañamiento del proceso, por la formación permanente de los colaboradores, por el exigente ambiente higiénico de las instalaciones, por la verificación frecuente de controles y procedimientos, por la mejoría continua inculcada en los planes de actividad, PEIPEN sigue empleando todo su sistema de gestión de calidad de forma a llevar a sus consumidores productos seguros, con elevada calidad y valor, queriendo garantizar la total satisfacción de sus clientes.